阿波丸沉船打捞工程告一段落,然而,关于黄金、白金、工业钻石和“北京人”头盖骨化石等贵重物品的去向,却成为世人争议的新焦点。曾参与打捞工程组织、指挥的张代吉(交通部救捞局巡视员、交通部潜水员考核委员会常务副主任)认为有四大可能:
第一,当年宝藏运输采取了声东击西之策,并未装上阿波丸,而是由其他渠道运回了日本;
第二,由于最初的情报和资料有误,以讹传讹,那些宝藏也许根本就不存在;
第三,打捞人员曾在船舱内发现一只腐蚀的潜水鞋底,以此联想到阿波丸可能已经被人盗捞过,但在战争期间,日本、台湾、香港、澳门等国家及地区,当时并不具备这样的打捞条件和能力;美国虽有能力打捞,但按照美国的惯例,60多年后早该解密,其打捞情况一定会公诸于世;新中国成立后,牛山岛海域一直在中国的监控之下,如有可疑外籍船舶在此海区进行较长时间的抛锚作业,应当会被发现,并被驱逐,所以,有人认为潜水鞋底是船上自用的,而不是盗捞者落下的;
第四,阿波丸可能设有自爆装置,遇到紧急情况自动装置引爆,船体破坏极大,因此在顷刻间沉没。如果价值连城的财宝是在新加坡装上阿波丸的,那么,仍在沉船残骸里面的可能性微乎其微,极大可能是,在剧烈爆炸和强大的海水冲击作用下,使这批宝物已散落在阿波丸沉没附近的大海深处,并覆盖了厚厚的淤泥,难以搜寻。