查士丁尼执政时期曾建造两座教堂,后来成为拜占庭帝国无上荣耀的象征,无论是在东方还是西方,拜占庭都成了基督教真理普照大地的灯塔。其中一座位于意大利沿海地区的拉韦纳城(Ravenna),是形式朴素却又弥足珍贵的圣维塔莱教堂(San Vitale);另一座则是君士坦丁堡城内的圣索非亚大教堂(Hagia Sophia),这座富丽堂皇的教堂有着庞大的穹顶结构,于公元537年的耶稣圣诞日落成。
第一座圣索非亚大教堂是由君士坦丁建成的,采用方形礼堂的形式,可惜后来毁于一场大火,正是在这座建筑的原址上,查士丁尼建起了新的圣索非亚大教堂,而且这次是名正言顺地敬献给“神圣的智慧”(圣索非亚)——教堂由数学家米利都的伊西多尔(Isidore of Miletus)和特拉勒斯的安提莫斯(Anthemios of Tralles)基于罗马的科学与工程学知识设计而成。他们将科学智慧转化成了无与伦比的华美杰作——希腊学者和史学家普罗柯比(Procopius)在记述查士丁尼时期建筑时将其描述为“美轮美奂、蔚为壮观”,而且“令目睹者叹为观止,耳闻者难以置信”[130]。